Премьер-лига была сформирована в своем нынешнем формате в сезоне 2013/2014. В ней принимают участие 16 команд, играющих друг с другом в два круга. Победитель становится чемпионом СФЛ и награждается помимо медалей и трофея правом бесплатно принимать участие в следующем сезоне регулярного первенства. Остальные представители призовой тройки получают сертификаты от партнеров Лиги.

По итогам каждого игрового года в элитном дивизионе гарантировано остаются восемь команд. Команды, занявшие с 9-е по 12-е места, играют стыковые матчи с командами Первой и Второй лиг за право сохранить прописку. Обладатели 13-16 мест вылетают в Первую лигу.

Чемпионом первого сезона СФЛ стали «Телеги» (СПбГАСУ) – 2012/2013. В сезоне 2013/2014 доминировали «USB» (СПбГЭУ).  Через год, в сезоне 2014/2015 «Телеги» вернули себе звание лучших из лучших. В последнем розыгрыше Премьер-лиги сезона 2015/2016 победителем стал его дебютант, «Кастилья» (Горный университет).

В сезоне 2016/2017 победителем Премьер-лиги снова стала «Кастилья». Команда стала первой в истории СФЛ, кому удалось удержать чемпионский титул. Также впервые лучшим игроком Лиги стал человек, чья команда стала чемпионом по итогам регулярного сезона - Евгений Чуприков. Это коснулось и награды лучшего вратаря, который получил капитан «красных» Константин Шитихин. Представители Горного университета также отметились в номинациях лучшего бомбардира и лучшего ассистента, которые получили Андрей Пендеев и Руслан Керимов соответственно (оба - «Союз»).